Por disposición del Virrey Toledo en 1572 se compraron las casas de Alonso de Hinojosa para adaptarlas como Casa de Cabildo. Cabe destacar que era usual (y casi universal) que las cárceles se encontraran en los pisos bajos de las Casas de Cabildo, ya que eran los Alcaldes Ordinarios los que administaban justicia en primera instancia. Cuando se estableció la Real Audiencia del Cusco en 1786 (gobernando el Virrey Teodoro de Croix), se le destinó para funcionar el segundo piso de las Casas de Cabildo, luego de desechar su instalación en el extinguido Colegio de la Compañía de Jesús (en ese momento funcionando como cuartel de tropa): "juzgó mas proporcionada la vivienda alta del ilustre Cabildo de aquella ciudad, cuyo costo se calculó solo de quatro mil pesos, consultómelo, como igualmente si la compra de los utensilios para el adorno y uso de las salas se haría en esta ciudad o en aquella. Llevado a Junta de Real Hacienda el asunto, considerada la moderación del gasto de la obra y ...